모듈을 완전 삭제하고싶은데 모듈을 지우고 phpmyadmin

네, 그렇게 db에 직접 접근해도 되구요.
아니면 (제거하고자 하는 폴더를 삭제하신 뒤) Profiler 모듈을 통해 각종 뒷처리 작업을 좀 더 편하게 하실 수도 있을 겁니다.